البته فرهاد مجیدی نیز با اصرار مرتضی محصص این دعوت را پذیرفت و در همان ابتدای کار هم اعلام کرده بود ممکن است نتواند به صورت کامل در جلسات حضور داشته باشد. در هر صورت اما پس از چند ماه و در سکوت، فرهاد مجیدی از این تیم چند نفره کنار گذاشته شد تا نه آمدن مجیدی کم حاشیه باشد و نه عزلش از این کمیته با دلیل خاصی انجام گرفته باشد. در برخی رسانه ها هم اعلام شد که او به دلیل مشغله ای که داشت و نمی توانست در جلسات حضور داشته باشد خیلی محترمانه از این کمیته کنار گذاشته شد اما شنیده های ما داستان را جور دیگری روایت می کند.
داستان عزل مجیدی از این کمیته از جایی شروع شد که این کمیته همواره از کی روش حمایت کرده است و اعضای آن برآیندی به نفع کی روش داشته اند تا منتقدین این مربی پرتغالی و این اتفاق هم به مذاق آقای دبیرکل خوش نمی آمد و در همین راستا آقای اسدی سعی در موازنه این نفرات داشته که بهترین نفر که بتوان او را به راحتی و به دلایل دیگر از آن جمع جدا کرد را هم فرهاد مجیدی در نظر می گیرد و با این بهانه که حضور کامل در جلسات ندارد از رئیس فدراسیون درخواست می کند که نفر جدیدی را جایگزین وی کند و طبق معمول نیز خواست های دبیرکل فدراسیون جناب علیرضا اسدی رخ می دهد مگر اینکه خلافش ثابت شود. فرهاد مجیدی پس از جام ملتها حمایت قاطعی از کی روش داشت و در مقابل آن هجمه شدید از سوی طیف مربیان سنت گرای فوتبال ایران از کی روش حمایت کرد. از آنجایی که کمیته فنی فدراسیون هم در مورد کی روش نظرات خودش را ارائه می دهد و چند وقتی است که این کمیته نقش زیادی در نظرات فدراسیون ایفا می کند به نظر می رسد که کنار گذاشتن مجیدی در واقع برای کمتر کردن تعداد موافقان کی روش در کمیته فنی فدارسیون بوده است که این کار هم به دستور دبیرکل فدارسیون صورت گرفته است.