اولین حضور سید رضا افتخاری در فوتبال بر می گردد به سال 1374 که وی در آن
تاریخ بعنوان دبیر کل فدراسیون فوتبال همکاری خود را با داریوش مصطفوی آغاز
کرد و تا سال 1377 در همین پست فعالیت خود را ادامه داد . با روی کار آمدن
صفائی فراهانی بعنوان سرپرست تیم ملی و به همراه کاروان این تیم راهی
مسابقات جام جهانی1998 فرانسه شد، و در سال 85 تا 86 بعنوان نائب رئیس دوم و
رئیس سازمان لیگ برتر همکاری خود را با کیومرث هاشمی ادامه داد. وی علاوه
بر این سمت ها از سال 88 تا 90 هم مدیر کل تربیت بدنی استان تهران و عضو
کمیته استیناف فدراسیون فوتبال بود. گفتنی است آخرین سمت رضا افتخاری که
هنوز هم در این سمت مشغول به فعالیت می باشد بعنوان مسئول کمیته فوتسال
است.